X档案封闭后，穆德（David Duchovny 年夜卫•杜楚尼 饰）和斯科莉（Gillian Anderson 吉莲•安德森 饰）被分隔。穆德受命执行监听工作，斯科莉则回到学院读书。 某日国会议员麦特森（Raymond J. Barry 饰）向穆德透露一条动静，称在波多黎各接收到外星人的电讯。为了在特种军队之前找到外星人的证据，穆德单身前去。得知动静的斯科莉赶到穆德住处，从电脑中的旅客名单中找到线索，尾随来到波多黎各。 在波多黎各阿雷希伯，穆德偶遇一个本地人，并从他手里获得一幅外星人的画。但不久后此人便古怪死去。穆德最终可否找到外星人来访的证据？